Cytoscape源自系统生物学,用于将生物分子相互作用网络与高通量基因表达数据和其他分子状态信息整合。其最强大的功能是大规模蛋白质-蛋白质相互作用、DNA蛋白质分析和遗传相互作用。
通过Cytoscape,这些生物网络可以在视觉环境中与各种分子状态信息(例如基因表达和基因型)集成,并且这些网络还可以连接到功能注释数据库。 Cytoscape 的核心是网络。一个简单的网络图包含节点和边。每个节点可以是一个基因、一个MiNRA、或者一个蛋白质等;节点(边)之间的连接代表这些节点之间的连接,包括蛋白质相互作用。蛋白质相互作用(pp)、DNA-蛋白质相互作用(pd)等。
安装教程
1.下载完成后,鼠标右击【Cytoscape 3.6.0】压缩包,选择【解压至此处】
2.找到【jdk-8u151-windows-x64】应用程序,右键选择【以管理员身份运行】它(JDK安装教程请参考:https://www.rjctx.com/21497.html)
3.回到Cytoscape 3.6.0文件夹,找到【Cytoscape_3.6.0…】应用程序,右键选择【以管理员身份运行】它
4.点击【Next】
5.勾选【我接受】,再点击【Next】
6.软件默认安装在C盘,可自定义更改软件安装位置,点击【Next】
7.点击【Next】
8.点击【Next】
9.软件安装中,稍等片刻
10.软件安装成功,点击【Finish】
11.回到桌面,点击任务栏的【开始菜单】,在【所有应用】中找到【Cytoscape软件图标】,将软件图标拖到桌面上,完成软件桌面快捷方式的创建
12.回到桌面,右键桌面上的【Cytoscape软件图标】,点击【打开】
13.点击【Close】
14.安装完成